همه کسانی که در مرحله اول رأی ندادند مخالف نظام نیستند 
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، میزان مشارکت در مرحله اول انتخابات را کمتر از حد توقع و خلاف پیش‌بینی‌ها خواندند و گفتند: این مسئله عللی دارد که اهل سیاست و جامعه‌شناسان آن‌ها را بررسی می‌کنند.
ایشان تصور برخی‌ها را مبنی بر اینکه هر کسی در مرحله اول رأی نداده، مخالف نظام است، صددرصد اشتباه خواندند و گفتند: ممکن است عده‌ای، از برخی مسئولان و یا حتی نظام اسلامی خوششان نیاید، همان‌گونه که آزادانه این حرف‌ها را می‌زنند، اما این ذهنیت که هر کسی رأی نداده متصل به این افراد و این طرز فکر است، کاملاً غلط و اشتباه است. 

حضور مردم، پشتوانه و مایه سربلندی نظام 
رهبر معظم انقلاب افزودند: خیلی‌ها مشکل و کار و گرفتاری دارند و یا به علل دیگر در رأی‌گیری شرکت نکردند که ان‌شاءالله در مرحله دوم اجتماع مردم پای صندوق‌های رأی، شوق‌انگیز و مایه‌ آبروی نظام باشد.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای مشارکت مردم را پشتوانه و مایه‌ سربلندی نظام خواندند و تأکید کردند: هر قدر مشارکت بهتر، صریح‌تر و روشن‌تر باشد، نظام برای تحقق اهداف خود در داخل و پیگیری اهداف در مجموعه امتداد راهبردی کشور، از توانایی بیشتری برخوردار خواهد شد که این مسئله فرصت بسیار بزرگی است. 
ایشان ابراز‌امیدواری کردند: خداوند توفیق بهترین انتخاب را به مردم عنایت فرماید تا فرد منتخب بتواند اهداف نظام و ملت را محقق سازد. 

حوزه‌های علمیه به حرکات جدید نیاز دارند 
رهبر معظم انقلاب در ابتدای این دیدار، برنامه‌های تحولی مدرسه عالی شهید مطهری را حرکتی ضروری و صحیح خواندند و گفتند: برنامه‌ها، باید با حفظ اصول و مبانی و بر حسب نیاز‌های زمان، نوبه‌نو متحول شود؛ چراکه حوزه‌های علمیه واقعاً به حرکات جدید نیاز دارند.
حضرت آیت‌الله خامنه‌ای با تأکید بر مسئله انضباط و اشراف مدیریتی بر فعالیت‌ها گفتند: مدرسه عالی شهید مطهری می‌تواند مظهر حوزه تهران بشود، ضمن اینکه به عنوان محیطی حوزوی و دانشگاهی باید افرادی را پرورش دهد که علاوه بر علم، دارای تقوا و تزکیه نفس
 باشند.