در قبرستان باغ طوطی شخصیت‌های مهمی دفن شده‌اند که در حوزه‌های مختلفی شهرت داشته‌اند. بسیاری از مشاهیر، شخصیت‌های سیاسی و اشراف حکومتی در محوطه اطراف حرم و به‌خصوص قبرستان باغ طوطی دفن شده‌اند؛ از جمله آیت‌الله کاشانی، آیت‌الله اثنی‌عشری، ملاعلی کنی و محمد قزوینی، قائم‌مقام فراهانی، ستارخان، امیری فیروزکوهی، شیخ محمد خیابانی، اسماعیل آشتیانی، دکتر بدیع‌الزمان فروزان‌فر، آیت‌الله حاج شیخ جواد فومنی حائری، آیت‌الله حسن آشتیانی، سید ضیاءالدین طباطبایی، آیت‌الله مجتبی تهرانی، محمدتقی فلسفی و... .